日前，在國家重點研發計劃和貝類產業技術體系等項目支持下，黃海水產研究所王崇明研究員團隊、楊愛國研究員團隊與德國阿爾弗雷德·韋格納研究所赫爾姆霍茲極地和海洋研究中心Umberto Rosani博士等合作，成功破譯魁蚶基因組，研究成果于7月9日正式發表在GigaScience雜志。該研究利用第二、三代測序和Hi-C染色體構象捕獲技術，構建了國際上首個染色體水平的蚶科動物基因組參考圖譜。研究揭示魁蚶基因組大小為885 Mb，Scaffold N50達到45 Mb，利用Hi-C技術成功將99.35%的組裝序列掛載到染色體上，經進一步分析發現魁蚶基因組中重復序列高達408 Mb，占基因組總長的46%。

魁蚶俗稱赤貝、血貝、大毛蛤，是一種大型海洋底棲經濟貝類，廣泛分布于太平洋西北部的日本海、黃海、渤海及東海沿岸，成貝個大體肥，肉質鮮美，經濟價值較高。近年來，我國魁蚶苗種生產和增養殖規模不斷擴大，經濟和社會效益顯著，然而其種質質量下降、病害高發等問題日趨嚴重。魁蚶及蚶科貝類基因組信息的匱乏成為我們理解其抗病、抗逆機制的障礙，破譯魁蚶基因組信息、開展重要性狀遺傳改良成為當下的重要課題。該項研究成果為蚶科貝類抗病抗逆、生長發育等重要性狀的遺傳解析以及種質改良等相關研究提供了重要理論支撐。

黃海水產研究所白昌明博士、辛魯生博士為該論文的共同第一作者，王崇明研究員為該論文的通訊作者。

全文鏈接：Chromosomal-level assembly of the blood clam,Scapharca(Anadara)broughtonii, using long sequence reads and Hi-C

https://academic.oup.com/gigascience/article/8/7/giz067/5530322