以主要海水養殖經濟品種為重點，圍繞種質資源保存與評價、良種培育技術、養殖生產保障關鍵技術、養殖工藝與設施裝備技術以及漁業環境及水產品質量安全監控技術、飼料研發與疾病診治技術等方向，研究開發產業關鍵共性技術、并進行集成應用與示范推廣，構建以提高產量、質量和生態效益為目標的現代海水養殖技術體系。以該技術體系為依托，可連續不斷地提供產業優良的種源，使產業擺脫依靠野生資源的現狀，提高生產的穩定性，保障從業人員生計的穩定性。優良品種可大大減少因病災害防治的用藥量、餌料的殘余量及養殖用水的自身污染，以保護生態環境系統。

該工程研究中心的主要發展方向和任務是：水產養殖生物遺傳育種技術的構建、海水養殖新資源的開發與應用、精準化生殖調控和優質種苗培育技術集成、高效養殖模式和養殖技術工藝優化、海水養殖專用配合飼料的研發、水產病害防控診治技術構建、漁業環境及水產品質量安全監控。

中心功能一是作為現代漁業先進技術集成、中試、推介的重要平臺，整合實驗室基礎應用研究成果，凝練養殖關鍵共性技術，集成創新形成工程化技術體系，為海水養殖提供實用化技術和成果轉化平臺；二是作為青島市海洋科技的科研實踐、人才培訓、產業技術支撐服務的窗口，積極有效地支撐青島藍色硅谷建設和發展，為該地區乃至全國海洋漁業的創新發展打造一個先行先試的孵化器。該中心的建成也將對加快科研成果向現實生產轉化，促進海洋漁業技術進步和核心競爭力的提高具有極為重要的現實意義和廣闊的前景，對促進和拉動整個海洋與水產業的可持續發展也具有舉足輕重的作用。