近日，由中國水產科學研究院黃海水產研究所紀曉峰等研究發明的“基于進化耦合分析的電壓-門控鈉離子通道結構模建方法”獲國家發明專利授權，專利號：ZL2017111591884。
本發明屬于結構生物學領域。首先通過rosetta的膜蛋白同源模建方法，以真核鈉離子通道NavPaS(PDBid：5X0M)三級結構為模板，初步構建組成Nav1.5孔道結構域的四個亞基結構。然后通過進化耦合分析的方法(DCA)，評估結構中實際和DCA預測所得的相互作用殘基對之間的重合度；結合打分函數，挑選得分和重合度都比較高的結構作為各個結構域的初始結構。然后將挑選出的四個亞基結構組裝并進行優化；從優化后的結構中進一步選取界面處重合度和RosettaMP得分都比較高的，以滿足評估條件的結構作為最終結構。
本發明克服了傳統的結構模建方法沒有充分考慮跨膜區域信息及模板同源性低、預測準確性差的缺點，可靠性高。
